フリードの誘いでフィールドワークに行くことになったリコたち。同行するのは、世界中をめぐってポケモンの調査をしているウィロー博士！そして、みんなで調査をする中、リコたちはフリードとリザードンが出会ったときの話を聞くことに。それは、フリードがまだ子どもで、リザードンもヒトカゲだった頃のこと…。明かされる、ふたりの出会い──。